Koronavirus/Sadržaj/Betakoronavirus

Betakoronavirusi (β-CoV ili Beta-CoV) jedan su od četiri roda koronavirusa u poddružini Orthocoronavirinae u obitelji Coronaviridae, reda Nidovirales. Oni su zamotani, jednolančani RNK virusi zoonotskog, pozitivnog smisla. Koronavirusni rodovi sastoje se od različitih virusnih rodova s rodom betakoronavirusa koji sadrži četiri takve vrste. U starijoj literaturi ovaj je rod poznat i kao koronavirusi grupe 2.

Virologija

Alpha i betakoronavirusi uglavnom zaraze šišmiše, ali također zaraze i druge vrste poput ljudi, deva i zečeva. Beta-CoV koji su uzrokovali epidemije kod ljudi uglavnom izazivaju vrućicu i respiratorne simptome. Oni uključuju:

   #SARS-CoV | Epidemija SARS virusa 2002. - 2004.
   #MERS-CoV | MERS
   #SARS-CoV-2 | Pandemija COVID-19

Morfologija

Virusi roda A razlikuju se od svih ostalih u rodu po tome što imaju dodatni kraći protein u obliku šiljka koji se zove hemaglutinin esteraza (HE) (P15776). Smatra se da je stečen od virusa gripe C.

Naziv Koronavirus potječe od latinskog corona, što znači 'kruna' ili 'halo', a odnosi se na njihovu sliku pod elektronskom mikroskopijom krunastih krojeva na njihovoj površini sličnih solarnoj koroni. Ovu morfologiju stvaraju virusni špic (S) peplomeri, proteini koji naseljavaju površinu virusa i određuju tropizam domaćina. Red Nidovirales nazvan je latinskim nidusom, što znači 'gnijezdo'. Odnosi se na proizvodnju ovog reda 3'-koterminalnog ugniježđenog skupa subgenomskih mRNA tijekom infekcije.

Riješeno je nekoliko struktura proteina šiljaka. Domena vezivanja receptora u Alpha i Betacoronavirus spič proteinu katalogizirana je kao InterPro: IPR018548. Šiljak protein, stroj za fuziju tipa 1, sastavlja se u trimer (PDB: 3jcl, 6acg); njegova jezgra struktura nalikuje proteini paramiksovirusa F (fuzija). Upotreba receptora nije jako očuvana; na primjer, među Sarbecovirusima, samo pod-linija koja sadrži SARS dijeli ACE2 receptor.

Galerija

Animacija morfološki ilustrovanog viriona SARS-CoV-2.
Morfološka ilustracija SARS-CoV-2 viriona.
Dijagram Koronavirusa čiji su špicevi u obliku kruna kao Korona sunca.